蒙巴薩港(港口代碼：KEMOM)位于肯尼亞東南沿海的蒙巴薩島上，有鐵路橋與海堤和大陸相連，瀕臨印度洋的西側，是肯尼亞的最大港口，也是東非的最大港口之一。該港是東非的工商業中心，主要工業有煉油、紡織、修船、水泥及農產品加工等。肯尼亞、烏干達的大部分外貿物資及盧旺達、坦桑尼亞以至扎伊爾東部、蘇丹南部的一部分貨物均由此中轉。蒙巴薩國際機場有定期航班飛往世界各地。 

港區主要碼頭泊位有16個，岸線長2343米，最大水深13.4米。裝卸設備有各種岸吊、可移式吊、龍門吊、集裝箱吊、抓斗吊、輪胎移動吊及滾裝設施等，其中集裝箱最大起重能力為40噸。港區有轉運貨棚面積達9.2萬平方米，另有冷庫及貨場等。碼頭最大可靠泊6.5萬載重噸的船舶。主要出口貨物為象牙、皮張、纖維、棉花、茶葉、椰干、咖啡、木材、糖漿、肉類及奶制品等，進口貨物主要有機械、車輛、紡織品、糧食、建材、食品、糖及工業品等。在節假日中圣誕節一般封港。其它節假日可安排作業，但須付加班費。 

蒙巴薩港位于非洲東岸中部，而由此向北直到紅海幾乎再沒有大港，向南直到南非只有德班港才能與其媲美，因此它是非洲東岸最大的港口。 

蒙巴薩港的條件在東非諸多港口中首屈一指。該港有各類萬噸級以上泊位21個，港口吃水9.45米以上，24小時通航，其中16、17和18號泊位是集裝箱專用泊位，碼頭吃水10.45米，有40噸集裝箱橋吊4臺。專用泊位緊張時，鄰近的14號散雜貨泊位也用來裝卸集裝箱。集裝箱港區前沿堆場，有專用鐵路直通肯尼亞首都內羅畢、肯尼亞第三大城市克蘇木和烏干達首都坎帕拉，每天都有集裝箱專列發往內羅畢。蒙巴薩港務局在內羅畢、克蘇木和堪培拉都設有CFS堆場。此外，從蒙巴薩到盧旺達、布隆還有"門到門"公路聯運服務。據不完全統計，蒙巴薩港每年集裝箱進出口約15萬～20萬TEU，大約是鄰近港口進出口量的3～4倍。 

桑給巴爾港（港口代碼：TZZAI）位于坦桑尼亞東北沿海桑給巴爾島的西海岸中部，西距大陸22 mile，瀕臨桑給巴爾海峽的東側，是坦桑尼亞的主要港口之一，也是世界上最大的丁香輸出港。桑給巴爾是東非重要駁運港，有1個國內機場和1個國際機場，有8家航空公司和12家海運公司提供航運和海運服務。該港交通運輸以公路為主。

港區主要碼頭泊位有4個，岸線長894m，最大水深9m。裝卸設備有各種岸吊、可移式吊、駁船及拖船等，其中駁船的最大容量每艘300噸。裝卸效率：袋裝或盤裝貨每天每工班400噸。碼頭最大可靠3萬載重噸的船舶。大船錨地水深達22m。主要出口貨物為丁香、椰子干、皮張、樹膠、椰子油、紅樹皮、海藻及海貝等，進口貨物主要有食品、建筑材料、五金工具、煙葉、酒及肥皂等。