出口企業在辦理出口退稅時要特別注意申報程序，注意時間觀念，以免造成損失。出口企業在辦理出口退稅時，應注意四個時限規定：
“30天”
外貿企業購進出口貨物后，應及時向供貨企業索取增值稅專用invoice或普通invoice，屬于防偽稅稅控增值稅invoice，必須在開票之日起30天內辦理認證手續。
“90天”
外貿企業必須在貨物報關出口之日起90天內辦理出口退稅申報手續，生產企業必須在貨物報關出口之日起三個月后免抵退稅申報期內辦理免抵稅申報手續。
“180天”
出口企業必須在貨物報關出口之日起180天內，向所在地主管退稅部門提供出口收匯核銷單（遠期收匯除外）。
“3個月”
出口企業出口貨物紙質退稅憑證丟失或內容填寫有誤，按有關規定可以補辦或更改的，出口企業可在申報期限內向退稅部門提出延期辦理出口貨物退（免）稅申報的申請，經批準后，可延期3個月申報。
出口貨物退(免)稅的稅種分類
根據現行稅制規定，我國出口貨物退(免)稅的稅種是流轉稅(又稱間接稅)范圍內的增值稅、消費稅兩個稅種；
出口貨物退(免)稅的稅款是出口貨物在國內生產、流通各個環節已繳納的增值稅和應繳納的消費稅。
流轉稅，是泛指所謂以商品為特征物件的稅種。就我國現行的稅制而言，流轉稅包括增值稅、營業稅、消費稅、土地增值稅、關稅及一些地方性工商稅種。
出口退稅附送材料
1. 報關單。
報關單是貨物進口或出口時進出口企業向海關辦理申報手續，以便海關憑此查驗和驗放而填具的單據。
2.出口銷售發票。
這是出口企業根據與出口購貨方簽訂的銷售合同填開的單證，是外商購貨的主要憑證，也是出口企業財會部門憑此記帳做出口產品銷售收入的依據。
3.進貨發票。
提供進貨發票主要是為了確定出口產品的供貨單位、產品名稱、計量單位、數量，是否是生產企業的銷售價格，以便劃分和計算確定其進貨費用等。
4. 結匯水單或收匯通知書。
5. 運單和出口保險單
屬于生產企業直接出口或委托出口自制產品，凡以到岸價CIF結算的，還應附送出口貨物運單和出口保險單。
6.有進料加工復出口產品業務的企業，還應向稅務機關報送進口料、件的合同編號、日期、進口料件名稱、數量、復出口產品名稱，進料成本金額和實納各種稅金額等。
7. 產品征稅證明。
8. 出口收匯已核銷證明。
9. 與出口退稅有關的其他材料。
目前，外商投資企業出口貨物退稅辦法包括“先征后退”和“免、抵、退”稅。“先征后退”是指生產企業自營出口或委托代理出口的貨物，一律先按照增值稅暫行條例規定的征稅率征稅，然后由主管出口退稅業務的稅務機關在國家出口退稅計畫內按規定的退稅率審批退稅。
計稅依據
“先征后退”辦法按照當期出口貨物離岸價乘以外匯人民幣牌價計算應退稅額。
“離岸價”(英文編寫為FOB價)是裝運港船上交貨價，但這個交貨價屬于象征貨價，即賣方將必要的裝運單據交給買方按合同規定收取貨款，買賣雙方風險劃分都是以貨物裝上船為界限。因此，FOB價是由買方負責租船訂艙，辦理保險支付運保費。
最常用的FOB、CFR和CIF價的換算方法如下：
FOB價=CFR價-運費=CIF價×(1-投保加成×保險費率)-運費
因此，如果企業以到岸價格作為對外出口成交的，在貨物離境后，應扣除發生的由企業負擔的國外運費、保險費傭金和財務費用；以CFR價成交的，應扣除運費。
計算公式
當期應納稅額=當期內銷貨物的銷項稅額+當期出口貨物離岸價×外匯人民幣牌價×征稅率-當期全部進項稅額
當期應退稅額=出口貨物離岸價格×外匯人民幣牌價×退稅稅率
以上計算公式的有關說明
① 當期進項稅額包括當期全部國內購料、水電費、允許抵扣的運輸費、當期海關代征增值稅等稅法規定可以抵扣的進項稅額。
② 外匯人民幣牌價應按財務制度規定的兩種辦法確定，即國家公布的當日牌價或月初、月末牌價的平均價。計算方法一旦確定，企業在一個納稅年度內不得更改。
③ 企業實際銷售收入與出口貨物報送但、外匯核銷單上記載的金額不一致時，稅務機關按金額大的征稅，按出口貨物報關單上記載的金額退稅。
④ 應納稅額小于零的，結轉下期抵減應交稅額。
舉例說明
某鞋廠2000年3月出口鞋30000打，其中：(1)28000打以FOB價成交，每打200美元，人民幣外匯牌價為1：8.2836元；(2)2000打以CIF價格成交，每打240美元，并每打支付運費20元、保險費10元、傭金2元，人民幣外匯牌價為1：8.2836元。當期實現內銷鞋19400打，銷售收入34920000元，銷項稅額為5936400元，當月可予抵扣的進項稅額為10800000元，鞋的退稅率為13%。用“先征后退”方法計算應交稅額和應退稅額。
計算出口自產貨物銷售收入：出口自產貨物銷售收入=離岸價格×外匯人民幣牌價+(到岸價格-運輸費-保險費-傭金)×外匯人民幣牌=28000×200×8.2836+2000×( 240-20-10-2)×8.2836=49834137.60(元)
當期應納稅額=當期內銷貨物的銷項稅額+當期出口貨物離岸價格×外匯人民幣牌價×征稅率-當期全部進項稅額=5936400+49834137.60×17%-10800000=3608203.39(元)
當期應退稅額=當期出口貨物離岸價格×外匯人民幣牌價×退稅稅率